秘藏於刀裡的“真相” 劃破漆黑的夜晚
正指引至月光之下――
斧江財團位於北海道函館的收藏庫，收到來自怪盜基德的一封預告信。據說這次基德的目標，鎖定與幕末時代新選組副隊長・土方歲三有密切關連的一把日本刀。平時只盜取名貴珠寶的基德，這次為什麼會鎖定在一把刀……？另一方面，關西的名偵探・服部平次與柯南，他們為了劍道大會也來到了函館。在預告的犯案日當天，平次能否看穿基德的變裝，順利將人追捕到手……！？
同一個時間，函館倉庫街上發現了一具遺體，胸部被割劃出十字形狀的傷痕。從搜查線索中發現，死者身分為在亞洲一帶活動的日裔美籍武器銷售商，人稱「死亡商人」，他正在尋找與戰時軍需產業密不可分的斧江財團第一代當主藏匿在函館某處的寶物。傳聞中，在當時是足以拯救日本戰敗局面的強力兵器……，而那個寶物與基德鎖定的日本刀又存在著某種關連。也正因為如此，針對著目標鎖定日本刀的基德，謎樣「劍士」的身影正一步步逼近……

爭奪天下的寶物推理戰，即將就此開幕――！